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制備型高效液相色譜法是通過高負載、高分離度的制備柱來實現高純度分離的色譜分離方法，其特點在于：(1)采用高柱效色譜柱，分離效率高；(2)應用范圍廣，對極性和非極性、離子型和非離子型、小分子和大分子、熱穩定性和熱不穩定性化合物均具有較好的分離效果，在藥物研究領域具有不可替代的地位；(3)處理量大，能夠滿足不同的分離需求；
黃酮類化合物是由兩個苯環通過三碳鏈相互連接而成的，具有C6–C3–C615個碳原子基本骨架的一類物質，其廣泛分布于各種藥用植物中，尤其是花、葉部位，約20％的中草藥中都含有黃酮類化合物，資源豐富。目前已知的具有生物活性的黃酮類化合物有很多，其活性主要包括抗心血管疾病、抗腫瘤、抗氧化、抗病毒等。
從植物、動物、微生物等天然材料中發現結構新穎且具有藥理活性的天然產物并進一步開發成新藥，是人類預防和治療疾病的重要渠道，也是國際天然產物領域關注的研究方向。采用高效、高分辨、多功能的分離技術是開展天然產物研究的關鍵環節之一。近十幾年來，制備型高效液相色譜法是天然產物化學研究中應用相對普遍、有效和相關技術發展較快的分離純化方法。
萜類化合物是由異戊二烯或異戊烷以各種方式連接而成的天然化合物，具有祛痰、止咳、鎮痛等生理活性。此類化合物的制備通常采用以C18為填料的反相色譜柱、甲醇–水溶液為流動相，調節洗脫強度時加入異丙醇、正己烷溶液，流速控制在3～10mL／min。朱玲娟等利用高效液相色譜儀和C18反相色譜柱(250mm×10mm，5μm)從莢果蕨中分離出了9種高純度的倍半萜類單體化合物，均為從莢果蕨屬植物中分離得到。此項研究發展了分離純化莢果蕨中倍半萜類的分離方法。
甾體類化合物(steroids)是基本母核為環戊稠多氫化菲的一類天然化合物，其在維持生命、調節性功能、治療皮膚疾病及控制生育等方面具有重要的生理、藥理作用。甾體藥物主要是指甾醇的衍生物,其可分為腎上腺皮激素、雄性激素、雌性激素和孕激素。各類型的甾體藥物都可以用HPLC成功的分離例如炔諾孕酮用內標法測定含量?，F代制備型高效液相色譜(Pre-HPLC)在中藥及天然產物成分的分離純化、對照品的制備、對映體的拆分、雜質的分離純化以及生物制藥方面得到了廣泛的應用。
